La chapelle fut édifiée en 1451 par Louis de Chantemerle, seigneur de La Clayette. Aspirant à une certaine indépendance, il souhaite avoir sa propre église et cette faveur lui sera accordée par l'évêque de Mâcon. De style gothique flamboyant, rare témoin de cette architecture en Brionnais, elle fut bâtie près de l'hôpital pour les pauvres. La Chapelle, lieu de culte principal de La Clayette, a été jusqu'à la Révolution une annexe de la paroisse de Varennes-sous-Dun. En 1790, les premières assemblées municipales se tiendront dans la chapelle sous la présidence de M. La Metterie, avocat et qui deviendra premier maire de La Clayette. Elle fut ensuite peu à peu délaissée jusqu'à ce qu'on n'y célèbre plus d'office. La municipalité a réalisé l'aménagement des abords de la chapelle : le jardin offre ainsi aux promeneurs un petit havre de paix. La chapelle, désaffectée, est aujourd'hui un lieu culturel qui accueille expositions, spectacles et concert.