Le musée a été crée en 2007 par Georges GODOT et des anciens du centre école aéronautique de Saint-Yan est installé sur le site de l'Ecole Nationale de l'Aviation Civile. Le but est de maintenir la mémoire et la sauvegarde du patrimoine du centre de formation de pilotes de ligne de Saint-Yan et de l'aérodrome.
Cette chapelle est le vestige de l'ancienne église paroissiale de Saint-Yan, construite à la période romane. Le chevet, avec ses lancettes (fenêtres en arc brisé très élancées), a été remanié au XIIIème siècle (période gothique). L'intérieur de l'édifice n'est pas accessible.