L'église de Bergesserin n’a conservé de l’époque romane du XIe siècle et XIIe siècle que le chœur, l’abside, la travée sous clocher et le clocher qui sont classés par les Monuments Historiques, par un arrêté du 12 janvier 1945. La nef et le transept sont modernes. Elle est dédiée à Saint Loup. Le chœur est tourné vers l'est, symbole de la Résurrection.

L’église est placée sous le vocable de Saint Sébastien et fut édifiée en 1739 (date visible dans le fond du chœur). Elle remplaça et faisait face à l’ancienne chapelle érigée au XVIe siècle qui servait d’église paroissiale et fut abandonnée puis démolie du fait de sa vétusté (emplacement de l’ancienne mairie-écoles). Du côté sud, l’église surplombe l’éperon barré fermé par la structure imposante du château médiéval de Berzé (Xe- XVe siècle, remanié au XIXe siècle).