La basse vallée du Doubs, classée zone Natura 2000, est un véritable joyau ornithologique et floristique. Cet espace abrite une faune et une flore particulièrement diversifiées que l’on peut découvrir en empruntant un sentier de randonnée.
La commune de Longepierre se situe au cœur de la basse Vallée du Doubs et propose deux sentiers de randonnée, dont un site naturel géré par le Conservatoire d'espaces naturels de Bourgogne.
L'église est placée sous le vocable de Saint-Étienne, elle a conservé son chœur ancien du XVe siècle, voûté d'ogives. Y est visible un tableau du peintre Camille Bouchet réalisé en 1849 : Lapidation de Saint-Etienne, réinstallé début 2020 après avoir été restauré.