L'église a conservé certaines parties romanes : l'abside, le choeur et la dernière travée de la nef ; à voir : le portail avec ses pilastres cannelés et ses chapiteaux ; les fresques gothiques de l'abside.
A proximité du village de Brancion, dans un pré en bordure de la route (D14) du hameau de Pierre levée se dresse une curieuse pierre druidique surnommée le menhir de la Pierre Levée, datant de plus de 4 000 ans, pesant environ cinq tonnes et haut de 3,8 mètres. Il fut christianisé, comme bon nombre de symboles païens, une croix en pierre fut posée à son sommet. Il aurait la vertu de protéger les bêtes des maladies.
Capella ad Brancedunum, à l’époque romaine, la Chapelle-sous-Brancion, est située au pied du nid d’aigle de Brancion, à un attrait certain, tant au point de vue du paysage que de l’architecture.
Ce village portait, au VIIe siècle, le nom d’Aquis, et plus tard celui de villa Aquarias. Devenue La Chapelle sous Brancion, où l’on peut trouver une magnifique fontaine nommée l’Aiguyères, forme à peine changée de l’Aquarias d’autrefois.
La commune regroupe trois hameaux : La Chapelle-sous-Brancion qui a donné son nom à l’ensemble, Collonge et Nogent, ainsi que les lieux-dits, Nobles et l’Echelette. Ils offrent un ensemble de demeures remarquables et diversifiées, dans leur style, leur origine et leur ancienneté.
Le paysage que l’on découvre dans son ensemble depuis les rebords de l’éperon rocheux de Brancion, esplanade dénommée à juste titre le "Paradis", est d’une harmonie et d’une pureté saisissantes.